Los Jardines Botánicos están destinados a establecer colecciones de plantas vivas con un sistema adecuadamente organizado de registros e información sobre el origen, taxonomía, distribución y condición de las plantas y las especies, con el fin de contribuir a la conservación del material genético vegetacional, enriquecer el conocimiento, facilitar la educación y el desarrollo cultural de la comunidad y mejorar la calidad de vida de los visitantes al ofrecerles belleza, lugares de relajación y contemplación y áreas de esparcimiento y recreación en ambientes naturales.

Las funciones señaladas representan una gran carga valórica para la institución que las asume. Es por esto que nuestra definición de Misión está precedida por el enunciamiento de los Principios Corporativos de la Fundación, los que se presentan a continuación:

• Consideramos que el reino vegetal es maravillosamente diverso y su diversidad se encuentra y depende de una amplia disposición de ecosistemas.
• Reconocemos que la calidad de vida del ser humano – y por cierto la existencia humana- depende de la diversidad de plantas, de áreas naturales y, en una escala amplia, de la salud de la biósfera.
• Estamos comprometidos en la conservación de la diversidad natural y en aprender de las investigaciones y valores necesarios para lograr esta conservación y el uso racional de la diversidad biológica y de los ecosistemas en que esta diversidad ocurre.
• Somos parte de una sociedad a la que nos debemos y el cumplimiento de nuestra función estará acorde con las demandas de ella, especialmente con las provenientes de la comunidad de la Región de Valparaíso y de la ciudad de Viña del Mar, donde nos ubicamos.